Новые подходы к образованию в биоинформатике: как НИУ ВШЭ — Санкт-Петербург и BIOCAD готовят вычислительных биологов
Сегодня программирование и вычислительные алгоритмы помогают биологам обрабатывать большие объемы данных. Междисциплинарный подход позволяет быстрее проводить эксперименты и разрабатывать современные лекарства. Как НИУ ВШЭ — Санкт-Петербург совместно с компанией BIOCAD готовит будущих специалистов для биотехнологической индустрии — читайте в нашем материале.
Питерская Вышка в партнерстве с биотехнологической компанией BIOCAD с 2021 года реализует магистерскую программу «Вычислительная биология и биоинформатика». Учебный план состоит из теоретических курсов (физика, математическое моделирование, анализ данных, программирование, молекулярная биология и так далее), практических занятий и научно-исследовательской работы. Студенты осваивают создание терапевтических молекул, построение моделей эффективности препаратов и разрабатывают алгоритмы моделирования биологических систем.
Выпускники программы успешно строят карьеру в биотехнологической индустрии и занимаются научными исследованиями. Например, Никита Вяткин разработал модель машинного обучения Bigrace для предсказания изменения эффекта мутаций на взаимодействие белков. Его однокурсник Павел Ким создал на основе нейросетей инструмент FOBo для изучения структуры большого числа комплексов антиген-антитело.
В 2025 году на программу было зачислено вдвое больше студентов, чем в 2024-м. Среди поступивших — выпускники разных направлений: прикладной математики, физики, биохимии, биофизики и других.
Павел Яковлев
Научный руководитель программы, вице-президент по ранней разработке и исследованиям BIOCAD
«Мы организовали процедуру раннего набора и выделили дополнительные места для сильных ребят — физиков, математиков и программистов, которые хотят решать интересные и сложные задачи на стыке ИТ, анализа данных и современной биоинформатики. Именно возможность получения прикладного образования, которое быстро может быть применено к решению реальных задач индустрии, пожалуй, главное преимущество нашей совместной с ШИФТом программы. В этом аспекте она является идейным и духовным наследником программы по биоинформатике Алферовского университета. Питерская Вышка дает большую свободу в построении образовательного процесса и реализации научного потенциала студентов», — рассказал научный руководитель программы, вице-президент по ранней разработке и исследованиям BIOCAD Павел Яковлев.
Игорь Елисеев
Академический руководитель образовательной программы «Вычислительная биология и биоинформатика»
«Коллеги из индустрии концептуально помогают нам разрабатывать учебные планы и подбирать преподавателей. Эту помощь невозможно переоценить. В этом году компания поддержала нас и увеличила количество спонсируемых мест, теперь у нас учится еще больше талантливых ребят. Благодаря совместным проектам с ведущими научными институциями наши студенты могут заниматься исследованиями совместно с экспериментальными лабораториями Академического университета им. Ж. И. Алферова, Института биоорганической химии РАН, а также Института экспериментальной медицины», — подчеркнул академический руководитель программы Игорь Елисеев.
Чтобы сформировать общую базу знаний, студенты проходят курс адаптационных дисциплин. Кроме того, вышкинцы будут изучать молекулярную биологию, иммунологию и биотехнологию.
«У меня математический склад ума, и мне нравится биоинформатика. Питерская Вышка привлекла междисциплинарным подходом — здесь много математики, программирования и биологии. Я буду продолжать исследовать эволюционную биологию и структурную информатику», — отметил студент 1-го курса магистерской программы «Вычислительная биология и биоинформатика» Даниил Кипер.
«По предыдущему образованию я физик. Сейчас меня интересуют вопросы молекулярной динамики, моделирования, DFT-теории, докинга. Магистерская программа в Питерской Вышке полностью совпадает с моими научными интересами. Я хочу восполнить недостающие знания по другим дисциплинам, например в программировании, и в перспективе устроиться в индустрию либо пойти в науку», — пояснила студентка 1-го курса магистерской программы «Вычислительная биология и биоинформатика» Агата Платонова.
По словам академического руководителя, в новом учебном году планируется масштабная работа над исследовательскими проектами: «Мы приветствуем экспериментальный подход и вовлеченность в конкретную тематику. Первокурсники посетят исследовательский центр BIOCAD в Стрельне и пройдут летнюю стажировку в компании.
Студенты второго курса будут продолжать работу над выпускными квалификационными работами: оценкой и оптимизацией белковых интерфейсов (для моноклональных антител), поиском биологически активных пептидов врожденного иммунитета в транскриптомных данных, а также разработкой более эффективных алгоритмов гуманизации антител», — добавил Игорь Елисеев.
С 26 по 31 января 2026 года в НИУ ВШЭ — Санкт-Петербург пройдет первая Зимняя школа «Биоинформатика и молекулярное моделирование». В рамках мероприятия будут три взаимосвязанных блока, позволяющих участникам пройти путь от фундамента биоинформатики к реальным исследовательским навыкам и собственным проектам: лекции, семинары и мастер-классы, проектная работа. Регистрация открыта до 30 декабря.