Вычислительная биология и биоинформатика

«Вычислительная биология и биоинформатика» — магистерская программа, реализуемая компанией BIOCAD совместно с НИУ ВШЭ Санкт-Петербург.

Многие программы по модному сейчас биоинформатическому направлению предлагают обучение именно алгоритмам обработки биологических данных и, как правило, это касается работы с геномами, транскриптомами и прочими видами строчек из символов определенного алфавита. Иногда к работе с этими биологическими объектами применяют машинное и глубокое обучение, но вычислительная биология намного шире: в нее входит и работа со структурами молекул (критически важная для фармацевтических задач), и работа со сложными динамическими системами, и предсказание условий сборки и наработки биологических молекул.

Так как все перечисленные выше задачи необходимо решать прямо сейчас, компания BIOCAD приняла решение разработать и запустить данную программу, ориентируясь на возможность взращивать компетентные кадры, которые не нужно обучать еще пару лет после приема на работу. Все знания, которые необходимы для успешной академической карьеры и развития вычислительной биологии в России и мире, выпускники программы также здесь получат.

Программа предназначена для физиков, математиков и программистов, которые хотят научиться применять свои навыки для решения задач в области вычислительной биологии. 

У абитуриентов должен быть хороший математический бэкграунд, включая знания математического анализа, теории вероятностей и прочих базовых предметов 1 и 2 курса бакалавриата. 

Также среди ожиданий от поступающих – отсутствие страхов перед физикой и биологией, которые требуют нематематического мышления. Для того чтобы освоить программу, не нужны специальные знания в области химбио направления – в ходе обучения будут прочитаны все дисциплины, необходимые для понимания молекулярной биологии и современных биотехнологий.

И, конечно, никуда без навыков самоорганизации и должной мотивации — нагрузка будет интенсивной и будущим студентам важно заранее здраво принять необходимость уйти в учебу «с головой» (*около 20 часов в неделю вам предстоит проводить на занятиях и еще столько же — за выполнением домашних заданий).

Ознакомиться со всеми пререквизитами и подготовиться к поступлению поможет информация из блока «Подготовка» во вкладке «Абитуриентам».

• программа разработана совместно с ведущей биотехнологической компанией России — BIOCAD, которая прекрасно понимает, что должны знать и уметь специалисты данной сферы, поэтому в программе представлены специальные профильные предметы от практиков отрасли;
• в рамках научно-исследовательской деятельности программа будет предоставлять актуальные и значимые прикладные задачи биотехнологической индустрии и наставников, представляющих науку и бизнес;
• программа является междисциплинарной и удачно сочетает в себе элементы вычислительной физики, математического моделирования, анализа данных, программирования и молекулярной биологии, что позволит вам получить великое множество полезных знаний и навыков;
• платные места на программе финансируются компанией;
• на программе предусмотрена стипендия до 12 000 рублей, размер которой определяет успеваемость;
• в формате социальной стипендии предоставляется компенсация стоимости проживания в общежитии для иногородних студентов.

На программе готовят выпускников к тому, чтоб они могли максимально быстро влиться в процесс создания лекарственных средств и новых методов их рационального дизайна. Специалисты по биоинформатике в BIOCAD объединяют в себе научные и инженерные компетенции. На практике это выражается в задачах по анализу данных из открытых (и не только) источников, написанию высокопроизводительного кода, реализующего оригинальные алгоритмы над строками и графами, построению предсказаний свойств на основе методов машинного обучения, разработке и оптимизации протоколов термодинамических вычислений. А, главное, эти специалисты дают рекомендации, что нужно сделать с той или иной молекулой, чтоб скорее получить лекарственный препарат с заданными свойствами.

Но не надо считать, что такая специальность уникальна лишь для компании BIOCAD. Уже много лет существуют компании Schrodinger и Chemical Computing Group, эффективно реализующие вычислительные протоколы для большой фармы. Google, наигравшись в настольные и компьютерные  игры, основал Isomorphic Labs для приложения машинного обучения и структурной биоинформатики к задачам создания новых лекарственных средств. Да, и все крупные фармацевтические и биотехнологические компании первого эшелона обзавелись соответствующими отделами, ведь за последние 10 лет не вышло, пожалуй, ни одного препарата, в разработке которого не участвовали бы вычислительные методы.

Рост российской фарминдустрии последних лет показывает, что очень скоро высокая потребность в специалистах подобного профиля придет и на отечественный рынок.

Отбор кандидатов осуществляется по результатам вступительных испытаний, проводимых в форме письменного экзамена и устного собеседования с представителями компании BIOCAD (к собеседованию допускаются только абитуриенты, успешно прошедшие письменный экзамен).