Международное академическое сотрудничество

Проект «Международное академическое сотрудничество Металлизированные фталоцианины как высокоэффективные фотосенсибилизаторы в фототерапии рака»

Проект реализуется в рамках совместного сотрудничества на базе научно-учебной лаборатории био- и хемоинформатики (НИУ ВШЭ - Санкт-Петербург) и ключевой лаборатории фотонаномедицины и экспериментальной терапии (Медицинский колледж, Университет Цзясин).

Цели проекта

научные:

1) выявить и аннотировать-обобщить низкомолекулярные ингибиторы белков, опосредующих реакцию теплового шока и протеотоксический стресс после ФДТ;

2) отобрать 5 ингибиторов для каждого сигнального пути клеточного выживания и продемонстрировать их взаимодействие с соответствующей мишенью с помощью молекулярной динамики и вычислительного молекулярного моделирования;

3) предоставить in vitro доказательства фармакодинамической эффективности ингибиторов для улучшения терапевтического результата. Достижение этих этапов послужит поводом для последующих исследований in vivo по доказательству концепции (proof-of-concept).

- образовательные:

будут проводиться совместные научные семинары и международный обмен в форме стажировок в лабораториях-участницах. Студенты и аспиранты смогут увидеть методы проведения сложнейших расчётов на серверном оборудовании и последующий анализ их результатов.

-прикладные:

Все, что будет разработано в части формул (например, активные соединения, инкапсулированные в наночастицы), попадет в сферу интеллектуальной собственности и будет оценено с помощью коммерческих траекторий после завершения соответствующих исследований (фармакокинетика, фармакодинамика, токсикология).

Задачи проекта

а) Построить и вычислительно верифицировать структуры цинк-фталоцианина (ZnPC) и алюминий-фталоцианина (AlPC);

б) Провести расчеты молекулярной динамики ZnPC и AlPC в явной модели растворителя.

в) Провести моделирование взаимодействия мономерных ZnPC и AlPC по отдельности в липосомах (выраженных в виде мембраны), ЛПНП и ЛПВП для определения термодинамических равновесий в каждой среде;

г) Провести моделирование взаимодействия мономерных ZnPC и AlPC по отдельности с альбумином для определения термодинамических равновесий в каждой среде;

д) Провести моделирование влияния координированного металла на термодинамическое равновесие в модельных бислоях дипальмитоилфосфатидилхолина (ДПФХ) и водной среде. Провести вычислительные тесты на  внутримембранную стабильность фталоцианинов с координированными Zn и Al;

е) В модельных бислоях и водной среде рассчитать (де)стабилизирующее влияние длины ацильной цепи фосфолипида на ZnPC и AlPC;

ё) Определить влияние полиэтиленгликоля, конъюгированного с DSPE, на термодинамические равновесия фотосенситайзера в бислоях DPPC и наиболее стабильном бислое;

ж) Смоделировать влияние альбумина во внелипосомальном пространстве для определения, извлекается ли ZnPC из мембраны альбумином.

з) Смоделировать влияние липопротеинов низкой плотности (LDL) в экстралипосомальном пространстве в липидном бислое для определения  способности к диффузии ZnPC из мембраны LDL.

и) Смоделировать влияние липопротеинов высокой плотности (HDL) в экстралипосомальном пространстве в липидном бислое для определения способности к диффузии ZnPC из мембраны HDL.

й) Дать рекомендации по проведению экспериментов в лаборатории-Партнере и сравнить расчетные результаты с результатами экспериментов in vitro.

Аффилиация с проектом

Важно!
Учитываются публикации (типа article и review) в научных журналах, входящих в Список А, B, C и D и не имеющие у авторов – работников НИУ ВШЭ ссылки на иные источники финансирования.

Аффилиация с университетом:
На русском языке:

Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»

На английском языке:

HSE University / National Research University Higher School of Economics

Пример указания на источник финансирования научного исследования, в рамках которого осуществляется публикация:

На русском языке:

Статья/монография/глава подготовлена в ходе/в результате проведения исследования/работы в рамках проекта «Международное академическое сотрудничество» НИУ ВШЭ.

На английском языке:

The article/review was prepared within the framework of the project “International academic cooperation” HSE University.

Страница проекта с привязанными публикациями